Фамилия Мельгунов происходит от прозвища Мельгун, которое в старых русских говорах имело два связанных смысла. Первый — чисто физиологический: так называли человека, который часто моргает или подмигивает. Второй — уже по поведению: мельгуном могли окликнуть легкомысленного, игривого, шутливого человека. Согласитесь, что оба значения легко соединяются в одном образе — человек с живым, бегающим взглядом, себе на уме, который словно постоянно подмигивает собеседнику.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: суффикс -ун в прозвище Мельгун указывает на деятеля, склонного к действию, как в словах «бегун», «говорун» или «крикун». Основа же «мельг-» родственна глаголу «мелькать» — отсюда и смысл «мельтешить, часто моргать». Так что прозвище не было оскорбительным, скорее метким наблюдением за привычкой или характером.

Прозвище закрепилось за человеком как основное именование, а его потомки уже получили фамилию Мельгуновы по стандартной модели притяжательных прилагательных: Мельгунов — сын Мельгуна. Такая форма с суффиксом -ов типична для русских фамилий, образованных от прозвищ, и не несет сословной окраски: её могли носить и крестьяне, и служилые люди.

Среди известных носителей фамилии — Сергей Петрович Мельгунов (1879–1956), русский историк и политический деятель. Его научные работы, в том числе по истории революционного движения и Гражданской войны, до сих пор переиздаются, что делает фамилию заметной в интеллектуальной истории России.

Интересно, что фамилия не имеет отношения к географическим названиям или именам собственным — она чисто прозвищная, что роднит её с такими фамилиями, как Моргунов (от «моргать») или Мигалов (от «мигать»). Впрочем, если Моргунов и Мигалов прямо указывают на действие, то Мельгунов добавляет оттенок игривости и лёгкости, что делает её чуть более сложной для однозначной трактовки.