Фамилия Мелкунов — наглядный пример того, как русская фамилия может иметь нерусскую основу. Она образована от имени Мелкун, которое, в свою очередь, восходит к армянскому имени Мелкон (Мелкум). В армянском языке Мелкон — это форма имени Мхитар, что означает «утешитель». Таким образом, в основе фамилии лежит не прозвище или ремесло, а личное имя, которое в крестьянской среде могло передаваться от отца к сыну.

Модель типично русская: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей сын?» — Мелкунов). Фамилии на -ов в России — самые массовые, и Мелкунов здесь не исключение, хотя сама основа встречается реже, чем, скажем, Иванов или Петров. В русском языке имя Мелкун могло звучать как уменьшительное или обиходное от крестильного имени, но в данном случае оно, скорее всего, пришло вместе с носителем армянского происхождения, обрусевшим в процессе ассимиляции.

Географически фамилия Мелкунов тяготеет к югу России и Северному Кавказу, где исторически были сильны армянские диаспоры (Ставрополье, Кубань, Ростовская область). Встречается она и в Закавказье, но там чаще фиксируется в форме Мелконян или Мелкумян. В центральных и северных регионах России фамилия редкая, что подтверждает её региональную привязку.

Интересно, что фамилия Мелкунов не имеет отношения к слову «мелкий» или «мел» — это случайное фонетическое совпадение. В ономастическом словаре Б. Унбегауна такие фамилии с армянскими корнями, адаптированные русским суффиксом, описываются как результат межэтнических контактов. Версия о происхождении от прозвища «Мелкун» (например, от глагола «мелькать» или диалектного «мелкий») маловероятна: в говорах такое прозвище не зафиксировано, а имя Мелкон хорошо известно.

По сословию предки Мелкуновых могли быть как крестьянами, так и мещанами, но в южных регионах — часто казаками или иногородними армянскими переселенцами, занимавшимися торговлей или ремеслом. Точных данных о дворянском происхождении нет, фамилия не входит в родословные книги, что указывает на её народные корни.