Скорее всего , прозвище Мелькун происходит от глагола «мелькать» - «мерцать, мельтешить» или «мельчить, измельчать». Скорее всего, это прозвище получил человек, который часто мигал. Однако так могли называть и того, кто имел суетливый, надоедливый характер. Согласно другой гипотезе, это прозвище относилось к числу «профессиональных» именований, содержащих указание на род занятий человека. Например, Мельцом, Мелькуном иногда называли человека, который молол что-либо ручным жерновом. Веселовского, где записаны Мельгунов Борис Прокофьевич, 1595 г., Рязань; Мельгунов Андрей Игнатьевич, 1676 г. Так и прозвище Мелькун закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Мелькунов. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Мелькун, со временем получил фамилию Мелькунов.