Фамилия Меникова — одна из тех, где сразу бросается в глаза суффикс -ов-. В женском варианте он превратился в -ова, а основа — Меник. В русской модели фамилий суффикс -ов/-ев указывает на принадлежность: «чей?» — «Меников», то есть сын или потомок человека по прозвищу или имени Меник. Сама основа Меник — это краткая, народная форма от крестильного имени Меней (Мений). Полное имя Меней — редкое, но встречалось в святцах; в быту его легко сокращали до Меник, добавляя уменьшительный суффикс -ик, как в фамилиях Вадиков, Сеников.

Есть и другая, менее очевидная версия. Суффикс -ик мог указывать на человека по характерному признаку или занятию. В северных и сибирских говорах «меня» или «мена» означала обмен, мену. Меником могли прозвать менялу, торговца, который менял товары, — такое прозвище было вполне конкретным и цепким. Тогда фамилия Меников — не от имени, а от прозвища, закрепившегося за родом мелких торговцев.

Географически фамилия Меникова встречается не повсеместно. Основные очаги — Поволжье и Урал, особенно в Пермском крае и Удмуртии. Там в XIX веке фиксировались крестьяне с фамилией Мениковы, что говорит о её крестьянском происхождении. Дворянских родов с такой фамилией не известно.

С точки зрения словообразования фамилия простая и прозрачная. В отличие от фамилий на -ский, она не несёт топонимической нагрузки — не связана с названием деревни или местности. Это чисто патронимическая или прозвищная модель, характерная для основной массы русского населения. Мениковы — это люди, чей предок носил либо редкое церковное имя в обиходной форме, либо прозвище, связанное с меновой торговлей. Второй вариант кажется более живым и вероятным для крестьянской среды.