Фамилия Менковская — типичный пример того, как польская или западнорусская топонимическая модель прижилась в русском языке. Суффикс -ск- указывает на происхождение от географического названия: в основе лежит имя населённого пункта Менково или Менков. Таких деревень и хуторов несколько в Беларуси, на западе России и в Польше (например, Менково в Смоленской области или Менкув в Мазовецком воеводстве). Первым носителем фамилии мог быть человек, который переселился из такого места и получил прозвище «Менковский» — то есть «тот, кто из Менкова». Окончание -ая в женском роде — стандартная русификация: в польском варианте фамилия звучала бы как Męnkowska или Mienkowska, а в русском её привели в согласование с окончанием прилагательного.

Корень фамилии, скорее всего, восходит к личному имени Менька — уменьшительной форме от Менандр, Меней или, что вероятнее, от Меншик (производное от «меньшой» — младший сын). В северо-западных говорах «менька» могло означать и «малыш», «младшенький». Таким образом, название деревни Менково, скорее всего, образовано от прозвища или имени первого поселенца.

В отличие от более частых фамилий на -ов/-ев, Менковская встречается редко и имеет чёткую региональную привязку. По данным современных исследований, основная масса носителей сосредоточена в Брестской и Гродненской областях Беларуси, а также в приграничных районах Польши. В России фамилия единична. Социальный состав был разнородным: в Речи Посполитой такую фамилию могла носить как мелкая шляхта, владевшая фольварком Менково, так и крестьяне, взявшие фамилию по месту жительства после отмены крепостного права.