Фамилия Менлибаева ведет свое начало от двух тюркско-татарских слов: «менле» и «бай». Первое из них в переводе на русский язык означает «порядочный, добропорядочный, деликатный, тактичный», а второе — «господин, богатый, влиятельный человек». Менее вероятной представляется гипотеза, согласно которой, первая часть фамилии Менлибаева восходит к мусульманскому мужскому имени Минле, которое означает «с родинкой, имеющий родинку». Если ребенок рождался с родинкой, ему давали имя с компонентом «минле». Если родинку обнаруживали по прошествии значительного времени с момента рождения ребенка, ему давали новое имя, в состав которого входило слово «минле». Кроме того, это слово использовалось как синоним красоты, миловидности, обаяния. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Менлибаевых можно лишь на основании генеалогических исследований.