Фамилия Мергинёв — редкий случай, когда корень слова почти наверняка не русский, а тюркский или кавказский. Основа «мергин» или «мерген» в тюркских языках (например, в казахском, башкирском, татарском) означает «меткий стрелок», «охотник», «снайпер». Это было личное имя или прозвище, которое давали человеку за выдающуюся меткость. Слово «мерген» встречается и в монгольских языках с тем же значением. Таким образом, Мергинёв — это русская фамилия, образованная от тюркского прозвища Мергин (или Мерген) с помощью патронимического суффикса -ёв (фонетический вариант -ев после мягкого согласного). Буквально: «сын Мергина».

Суффикс -ёв указывает на то, что фамилия оформлялась в русской среде, скорее всего, уже после крещения предка-носителя прозвища. Сама фамилия не могла возникнуть в центральных великорусских губерниях — её география тяготеет к юго-восточным и восточным регионам, где русские жили в тесном соседстве с тюркскими народами: Оренбуржье, Поволжье, Урал, Сибирь, а также казачьи области (Оренбургское, Уральское казачьи войска). Именно там прозвища тюркского происхождения легко переходили в фамилии.

Ударение в фамилии, скорее всего, на последний слог — Мергинёв, что соответствует типичной русской модели для фамилий на -ёв. Написание через «ё» принципиально: если бы фамилия писалась как Мергинев, ударение падало бы на второй слог, и происхождение могло бы быть иным (например, от слова «мергин» как варианта «мерзкий» или «мерзнуть» в диалектах, но это маловероятно из-за редкого сочетания «ерг»). Вариант с «ё» однозначно отсылает к тюркскому корню.

Сравнение с однокоренными фамилиями помогает подтвердить версию. В русском ономастиконе известны фамилии Мергенёв, Мергасов, Меркулов (от имени Меркул, но это другое). Мергенёв — прямой аналог, только с другим вариантом основы (Мерген вместо Мергин). Разница в гласной «и/е» может быть следствием диалектного произношения или особенностей записи прозвища в документах. Фамилия Мергинёв — более редкая, чем Мергенёв, что говорит о её узколокальном бытовании.

Социальный контекст: предок-носитель прозвища Мергин почти наверняка не принадлежал к дворянству. Такие прозвища давали в среде служилых людей по прибору (стрельцы, казаки, пушкари) или государственных крестьян, где ценились воинские навыки. Меткий стрелок — это не ремесло, а личная характеристика, которая могла стать родовой памятью. Фамилия не имеет отношения к священническому сословию (там преобладают фамилии на -ский) и не встречается среди старых московских боярских родов.