Фамилия Меркицкий — редкий пример, где географическая основа почти наверняка перевешивает прозвищную. Строение фамилии прозрачное: суффикс -ицк- указывает на типично польский или западнорусский способ образования фамилий от названия места. В польской традиции суффикс -icki (а в русской передаче -ицкий) присоединяли к топонимам, оканчивающимся на -ице, -ицы или -ич. Следовательно, предок носителя фамилии был выходцем из населённого пункта с основой «Меркиц-» или «Меркич-». Таких топонимов в исторических польских и белорусских землях несколько: например, деревни Меркишки (в прошлом могли писаться как Меркице), или же вариант Меркичи — село в Гродненской области. Человек, переселившийся оттуда, получал прозвание «Меркицкий» — «тот, кто из Меркиц».

Менее вероятна, но не исключена версия от прозвища Мерка. В диалектах «мерка» — это и мера сыпучих тел, и небольшая ёмкость для измерения, и даже прозвище прижимистого или дотошного человека. Однако в таком случае мы бы ожидали фамилию Меркин или Мерков — по модели отчества на -ин/-ов. Форма на -цкий как раз и выдаёт «географический» след, а не прямое прозвище. Если бы основой служило имя Меркул (Меркурий) в народной форме Мерка, то фамилия, скорее всего, звучала бы как Меркулов или Меркин.

Фамилия Меркицкий — шляхетского типа, но это не говорит о дворянском происхождении конкретного рода. В Речи Посполитой фамилии на -ский/-цкий носили не только паны, но и крестьяне, переселившиеся из одной деревни в другую: землевладельцы фиксировали их по месту выхода. Поэтому предки Меркицких могли быть и мелкими боярами, и свободными хлебопашцами, и мещанами. В современных российских архивах фамилия встречается редко, в основном в центральных областях и на юге — это следствие поздних миграций с запада.

Отдельного внимания заслуживает написание: двойное «к» в корне (Меркицкий, а не Меркицкий с одним «к») — вариант, закрепившийся при русификации. В польском оригинале фамилия выглядела бы как Mierkicki или Mierżycki, где «rz» читается как твёрдое «ж». Переход в русскую графику дал «рк» вместо «рж» — это обычная адаптация.