Фамилия Мерконюк сразу обращает на себя внимание суффиксом -юк. В русском и украинском ономастиконе этот суффикс — классический маркер западноукраинского происхождения, особенно распространенный на Волыни, в Подолье и в Полесье. Он выполняет ту же роль, что и -ов/-ев в центральной России: образует фамилии от имени или прозвища отца, отвечая на вопрос «чей?». Таким образом, Мерконюк — это буквально «сын Меркона» или «человек из рода Меркона».

Самая сложная часть — основа «Меркон». Она не встречается в списках канонических крестильных имен, поэтому перед нами, скорее всего, прозвище. Лингвисты предлагают несколько версий его происхождения. Первая и наиболее вероятная: основа восходит к глаголу «меркнуть» или прилагательному «мерклый» — то есть тусклый, блеклый, теряющий свет. Прозвище Меркон могли дать человеку с неяркой внешностью, бледным лицом, или же в переносном смысле — нерасторопному, «незаметному» человеку. Вторая версия связывает фамилию с диалектным словом «меркотный» (дождливый, пасмурный) — такое прозвище мог получить человек, родившийся в ненастье, или тот, кто постоянно ходил хмурым.

Третья, более спорная гипотеза выводит основу от литовского или балтского корня. На западе Украины, особенно в пограничных с Беларусью и Польшей районах, встречаются балтские топонимы и антропонимы. В литовском языке есть слово merkti (мочить, замачивать) или merkis (знак, метка). Однако для фамилии Мерконюк такая связь менее доказательна, чем славянская «меркнуть», — слишком далеко отстоит семантика.

Интересно, что фамилия Мерконюк практически не встречается в центральных и восточных областях Украины, а также в России. Её география узка: это преимущественно Тернопольская, Хмельницкая и Ровенская области. Встречаются единичные носители в Польше, что подтверждает миграцию крестьянских семей в XIX — начале XX века. Социальный контекст фамилии — однозначно крестьянский или мещанский: суффикс -юк в массе своей закрепился за непривилегированными сословиями Речи Посполитой и Австро-Венгрии. Шляхта и духовенство предпочитали фамилии на -ский.

В написании фамилии возможны варианты: Мерконюк, реже Мерконюк с ударением на последний слог (в украинском языке ударение в фамилиях на -юк обычно падает на окончание). Встречается также полонизированная форма Merkoniuk, которую можно найти в старых метрических книгах католических приходов. Сравнение с однокоренными фамилиями (Меркун, Меркулов, Мерко) показывает, что основа «мерк-» в славянском именослове редкая, что делает Мерконюка фамилией с яркой региональной и лексической спецификой.