Фамилия Меркуоьев — редкий случай, когда написание расходится с привычным слуху вариантом. Скорее всего, вы столкнулись с искажением, возникшим на стыке устной речи и письменной фиксации. Нормативная форма, зафиксированная в ономастических справочниках, — Меркурьев. Разница в одну букву («о» вместо «рь») объясняется просто: в диалектном произношении или при неграмотной записи фамилии в документах мягкий знак и смягчение «р» могли выпасть, а гласный звук перешел в «о». Такое бывает, когда фамилию записывали на слух, не сверяясь с эталоном.

Основа фамилии — каноническое мужское имя Меркурий (от латинского Mercurius — имени бога торговли в римской мифологии). В святцах это имя носили несколько раннехристианских мучеников, поэтому оно было распространено в среде духовенства и крестьян. От имени Меркурий образовали притяжательное прилагательное «Меркурьев» — «сын Меркурия». Суффикс -ев указывает на принадлежность к отцу, что типично для русских фамилий, сформированных из отчеств в XVI–XVII веках. Форма Меркурьев — самая частая, она встречается по всей России.

Ваш же вариант — Меркуоьев — может быть либо местной особенностью произношения (например, в северных говорах, где «о» произносят более отчетливо), либо ошибкой писаря, который записал «Меркурьев» как «Меркуоьев», не разобравшись с мягким знаком. В любом случае, этимологически это та же фамилия: от имени Меркурий. Если вы ищете свои корни, стоит проверять оба написания в метрических книгах и ревизских сказках — предки могли фигурировать под разными вариантами, даже в пределах одного уезда.

Интересно, что в отличие от фамилий, образованных от «мирских» имен (вроде Меркулов, от прозвища Меркул), Меркурьев напрямую указывает на крестильное имя. Это значит, что первый носитель фамилии, скорее всего, был сыном человека по имени Меркурий. Сословной привязки нет: Меркурьевы встречались и среди крестьян, и среди купцов, и среди священников. Фамилия нередкая, но именно в написании с «о» она становится уникальным маркером — возможно, вы носитель редкого диалектного или канцелярского слепка XIX века.