Фамилия Меркуов — относительно редкая, и её происхождение напрямую связано с личным именем Меркул или Меркурий. В основе лежит каноническое христианское имя Меркурий, которое носил раннехристианский святой — великомученик Меркурий Кесарийский. В русской народной традиции это имя часто сокращали и переделывали в более простые формы: Меркул, Меркуша, Меркуха. От такой обиходной формы Меркул и была образована фамилия.

Внимание привлекает суффикс -ов. В русских фамилиях он стандартно указывает на принадлежность: «чей?» — Меркулов, то есть сын Меркула. Однако в фамилии Меркуов этот суффикс присоединился к основе, оканчивающейся на -у, что привело к выпадению конечного -л. Это не ошибка, а типичный для живой речи процесс упрощения: в быстром произношении «Меркулов» могло звучать как «Меркуоф», а затем закрепиться и на письме как Меркуов. Такие фонетические стяжения встречаются и в других фамилиях (сравните: Смирнов от Смирной, а не от Смирновой).

Географически фамилия Меркуов, скорее всего, имеет южнорусские или украинские корни, где подобные усечения встречаются чаще. Предки носителя этой фамилии, вероятнее всего, были крестьянами или посадскими людьми, а само имя Меркурий в народной среде давали не так уж редко — в святцах оно было, а в быту его не считали слишком «книжным».

Других версий, кроме как от имени Меркурий/Меркул, у этой фамилии нет. Связь с названием планеты или бога торговли в античной мифологии — вторична и опосредована тем же именем. Так что если вы встретили Меркуова, перед вами потомок человека, которого в семье звали просто Меркулом.