Фамилия Мерзун — один из тех случаев, когда прозвище перешло в фамилию почти без изменений, минуя типичные русские суффиксы. В ней нет окончаний -ов, -ин или -ский, что сразу указывает: перед нами либо украинская, либо белорусская основа, либо фамилия, застывшая в форме чистого прозвища.

Корень здесь — «мерз-», связанный с глаголом «мёрзнуть» и прилагательным «мёрзлый». Суффикс «-ун» в восточнославянских языках образует названия людей по характерному действию или свойству: бегун, ворчун, молчун. Соответственно, Мерзун — это «тот, кто мёрзнет», зябкий человек. Прозвище могли дать тому, кто постоянно кутался, жаловался на холод, или, напротив, родился в стужу. Вторая, менее вероятная версия — связь с диалектным словом «мерза» (грязь, слякоть), но тогда суффикс «-ун» дал бы значение «грязнуля» или «тот, кто возится в грязи». Однако первая трактовка, через холод, встречается в ономастике чаще.

Географически фамилия Мерзун тяготеет к западнорусским землям и Украине. Встречается она нечасто, что говорит о локальном происхождении — вероятно, из одной или нескольких деревень, где прозвище закрепилось за родом. В сословном плане носители, скорее всего, были крестьянами или мещанами: фамилии без суффиксальной обработки типичны для простонародья, а не для дворянства, которое чаще оформляло родовые имена по стандартной модели.

Интересная деталь: фамилия Мерзун сохранила архаичную ударную модель. В отличие от фамилий на «-ун» с ударением на суффикс (Ворчу́н, Болту́н), здесь ударение падает на первый слог — Ме́рзун. Это может указывать на то, что прозвище образовано не от глагола, а напрямую от имени прилагательного «мёрзлый» с помощью уменьшительного или пренебрежительного суффикса, что встречается реже. Таким образом, фамилия несёт в себе не только бытовую характеристику предка, но и следы живой народной речи, где слово могло звучать иначе, чем в литературном языке.