Фамилия Мешкотова — женская форма фамилии Мешкотов. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Мешкот. В русских говорах слово «мешкотный» имело два основных значения: «медлительный, неповоротливый» и «тягостный, обременительный». Скорее всего, прозвище Мешкот дали человеку неторопливому, флегматичному — тому, кого в других местах называли Копушей или Тюфяком. Менее вероятно, что прозвище закрепилось за человеком, который был «в тягость» окружающим, но и такой вариант нельзя исключать.

Обратим внимание на суффикс -ов- в мужской основе. Это типичная модель образования русских фамилий от прозвищ и мирских имён, оканчивающихся на твёрдый согласный: Мешкот → сын Мешкота → Мешкотовы. Суффикс -ов здесь указывает на принадлежность к роду конкретного человека. Фамилия довольно редкая и имеет ярко выраженный севернорусский след: по данным переписей и телефонных справочников, большинство Мешкотовых проживает в Архангельской области и соседних регионах, что косвенно подтверждает диалектную природу корня.

Примечательно, что слово «мешкотный» в значении «неповоротливый» зафиксировано в словаре Владимира Даля с пометкой «архангельское, вологодское». Это делает фамилию Мешкотова не просто случайным звукосочетанием, а маркером северного диалектного прошлого её носителей. В отличие от фамилий, образованных от названий профессий (Кузнецов, Плотников), эта фамилия — чисто качественная характеристика, данная предку по его характеру или поведению. Других версий происхождения, например от тюркских корней или от названия ремесла, не существует — основа однозначно русская, диалектная.