Фамилия Михайлюков образована от крестильного имени Михаил. Имя Михаил в свою очередь происходит от древнееврейского имени Микаэль, что означает «равный, подобный Богу». Архангелу Михаилу, небесному покровителю Яицкого (Уральского) казачьего войска, был посвящён Михайло-Архангельский собор (более известен как Старый собор) в Уральске — древнейшее здание города, заложен в 1741 году, освящён в 1751 году. От имени Михаил образовано целое «гнездо» фамилий. Одна из них – Михайлюков. Это «обрусевший» вариант украинской фамилии Михайлюк. Суффикс– юк в данном случае указывает на то, что основатель этой фамилии был сыном или учеником Михаила.