Фамилия Михни — редкий пример, когда географический суффикс спорит с отчеством. Скорее всего, перед нами форма родительного падежа от прозвища или имени Михня, что вписывается в восточнославянскую модель фамилий на -и/-ы, характерную для Украины и юга России. Такие фамилии (например, Величко — Велички, Коваль — Ковали) часто закреплялись за целым родом: «из семьи Михней» или «Михнины дети».

Основа — Михн- — это просторечная форма канонического имени Михаил. В украинском и белорусском быту имя дробилось на десятки вариантов: Михно, Михня, Михей, Михаль. Суффикс -н- здесь уменьшительно-ласкательный, как в Степан от Стефан или Иван от Иоанн. То есть Михня — «маленький Михаил», домашнее прозвище, которое потом перешло на потомков.

Встречается иная версия: фамилия могла возникнуть от прозвища Михня, связанного с глаголом «михать» (в диалектах — медлить, мешкать). Но в ономастических словарях эта гипотеза не находит опоры — слишком редкий корень, нет параллельных фамилий с таким значением. Куда правдоподобнее, что Михни — это «чьи?»: ответ на вопрос хозяина или писаря, записывавшего крестьян.

Суффикс -и (а не -ов или -ин) указывает на территорию бытования: чаще всего фамилия встречается на Украине, в Белоруссии и в южных областях России, куда пришла с украинской миграцией. Встречается и написание Михный, но форма Михни — исходная, именно как ответ на вопрос «чей?».

Сословно фамилия не маркирована: её могли носить и крестьяне, и казаки, и мещане. Дворянских родов с такой фамилией в «Бархатной книге» или «Общем гербовнике» нет — значит, предки были людьми незнатными, но с крепкой родовой памятью.