Фамилия Михолажин — довольно редкая, и её разговорная, «домашняя» форма сразу выдает способ образования. Перед нами яркий пример восточнославянской фамилии на -ин, которая происходит не от церковного, а от обиходного, диалектного варианта имени Михаил.

Основа здесь — Михолаж. Это уменьшительная или прозвищная форма от имени Михаил, но нестандартная. В русских говорах, особенно в западных и южных областях (Брянщина, Смоленщина, а также под влиянием украинского и белорусского языков), имя Михаил могло звучать как Михола, а ласкательный или уничижительный суффикс -аж давал форму Михолаж. Суффикс -аж в русских прозвищах встречается нечасто, но он фиксируется в ономастике: например, фамилии Бурлаж, Коряж, Плетаж. По аналогии, Михолаж — это «маленький Михаил» или «Михаил, которого зовут по-свойски».

Следовательно, фамилия Михолажин означает «сын Михолажа» или «принадлежащий Михолажу». Фамилии на -ин в этом регионе образовывались преимущественно в среде крестьян и посадских людей, реже — у духовенства. Дворянских фамилий с таким простонародным суффиксом практически не бывает. Так что предок носителя фамилии, скорее всего, был крестьянином или ремесленником, которого в быту звали не Михаилом, а именно Михолажем.

Географически фамилия тяготеет к зоне смешения русского и украинского языков. Наиболее вероятны корни в Черниговской, Гомельской или Брянской губерниях. Встречаются также написания Михолажин и Михолажен (с беглой гласной), но форма на -ин — самая устойчивая.

В целом, Михолажин — это фамилия-«однодневка» в хорошем смысле: она не пошла от прозвища по ремеслу или внешности, а застыла в виде ласкового обращения к человеку. Искать её в старых боярских списках бесполезно, зато она прекрасно сохраняет живую народную речь тех мест, где имя Михаил произносили на свой лад.