Фамилия Микшиев — относительно редкая, и её происхождение напрямую связано с личным именем. В основе лежит краткая форма одного из крестильных имён: скорее всего, это Николай, реже — Михаил. Дело в том, что в русской народной традиции имя Николай давало целый веер производных: Микола, Микула, Микша. Форма Микша — это уменьшительно-ласкательный вариант, образованный по той же модели, что и Митя от Дмитрий или Коля от Николай. Аналогично, от имени Михаил могли образовать Миша, а затем и Микша, хотя для Михаила такой переход менее типичен.

Суффикс -ев в фамилии указывает на типичную русскую патронимическую модель: Микшиев — это «сын Микшия» или «потомок Микши». В документах XVI–XVII веков встречаются люди с именем Микша: например, в писцовых книгах Новгородской земли упоминается крестьянин Микша Иванов. Это говорит о том, что имя бытовало в разных слоях населения, а не только в крестьянской среде.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным регионам России. В современных базах данных носители Микшиевых чаще всего встречаются в Архангельской, Вологодской областях, а также в Поволжье. Встречается вариант написания с одной «с» — Микшиев, и он закрепился именно в такой форме, без удвоения.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: основа (Микш-) + суффикс принадлежности (-ев). Замена окончания на -ий в исходном имени (Микша → Микший) — явление необязательное, но встречающееся в фамилиях, где основа оканчивается на шипящий или мягкий согласный. Так что Микшиев мог образоваться и от формы Микший, которая фиксируется в старых актах как полное имя.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Микша, Микшин, Микшов, Микшун — то Микшиев стоит особняком благодаря суффиксу -ев, который чётко указывает на отчество. Это делает фамилию более «книжной» и поздней по времени оформления, чем, скажем, Микшин, где суффикс -ин указывает на прямое обладание («чей?» — Микшин). Вероятнее всего, предок носителя фамилии Микшиев носил имя Микший или Микша и жил не позднее XVII века, когда фамилии начали закрепляться за родами.