Фамилия Микуля напрямую связана с личным именем Микуля — одной из народных, разговорных форм канонического имени Николай. В переводе с греческого Николай означает «победитель народов», и это значение напрямую перешло в основу фамилии. Такие сокращенные и уменьшительные формы, как Микуля, возникали в крестьянской и посадской среде естественным образом: полное церковное имя было длинным для повседневного обихода, поэтому его укорачивали, добавляя ласкательные или просто удобные для произношения суффиксы.

Сам корень «Микул» — это результат фонетического преобразования: начальное «Ни» отпало, а оставшаяся часть имени зазвучала как «Микула». В древнерусских текстах и былинах встречается форма Микула, например, знаменитый богатырь Микула Селянинович, олицетворявший крестьянскую силу. Таким образом, имя Микуля несло в себе оттенок простонародности, близости к земле и труду, в отличие от более книжного и официального Николай.

Фамилия образована по стандартной для восточнославянских земель модели: к основе Микул добавили суффикс -я, а затем фамильный суффикс принадлежности. Получается, что Микуля — это прямое именование без дополнительного патронимического суффикса, что встречается реже, чем Микулин или Микулов. Такая форма могла закрепиться за человеком, которого в округе знали просто по имени, либо за его потомками, если глава семьи носил это имя без изменений.

Считалось, что святой Николай, чьим именем названа фамилия, обладал силой воскрешать людей из мертвых, за что и был назначен епископом и наделен прозвищем Чудотворец. На Руси Николай Чудотворец был одним из самых почитаемых святых, его называли «скорым помощником» и покровителем путешественников, земледельцев и всех, кто оказался в беде. Поэтому имя Николай и его производные формы давали детям в надежде на защиту и заступничество святого.

Носители фамилии Микуля, скорее всего, происходят из западных или северных регионов России, а также из Беларуси и Украины, где формы на -я были особенно распространены. В документах XVII–XVIII веков такие именования фиксировались как полуимена, а позже закрепились в качестве наследственных фамилий. Сегодня фамилия встречается нечасто, что делает её характерным маркером родовой памяти о предке по имени Микуля.

Отдельного внимания заслуживает то, что фамилия не получила распространенного суффикса -ин или -ов, что указывает на возможное её закрепление в форме прозвища или внутрисемейного обращения. В некоторых говорах Микулой называли медведя, что добавляет еще один, более шутливый пласт значения, но основная версия всё же связывает фамилию с именем Николай, а не с животным.