Фамилия Миландин — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает прозвищную или «профессиональную» версию происхождения. Её основа — топоним, а не личное имя или ремесло.

Словообразовательная модель здесь — суффикс -ин, который в русских фамилиях обычно указывает на принадлежность: «чей?» — Миландин. Но основа не «Миланда» (такого имени или прозвища в русской традиции нет), а скорее всего, название населённого пункта Миландино. Такие деревни и хутора встречались на северо-западе России, особенно в бывших Псковской и Новгородской губерниях. Фамилия образована по схеме: «человек из Миландино» → «Миландин». Суффикс -ин здесь работает так же, как в фамилиях Москвин (из Москвы) или Тверитин (из Твери), только с местной, менее известной точкой на карте.

Менее вероятная, но допустимая версия — связь с итальянским городом Милан. Однако для русского крестьянского или мещанского сословия прямая «итальянская» этимология маловероятна. Скорее, фамилия могла возникнуть как «географическое» прозвище человека, торговавшего с итальянцами или побывавшего в тех краях, но это уже экзотика, а не норма.

Сама основа «Миланд-» может восходить к диалектному слову или прозвищу, но в доступных ономастических словарях (например, у Б. Унбегауна или В. Никонова) такая основа не фиксируется как распространённая. Это подтверждает версию о локальном, «деревенском» происхождении фамилии: она могла возникнуть в одной-двух волостях и не распространиться широко.

Таким образом, предок носителя фамилии Миландин — скорее всего, крестьянин или однодворец из небольшого поселения Миландино на северо-западе России. Фамилия — не искусственная (семинарская или «географическая» в дворянском смысле), а бытовая, возникшая естественным путём в XVIII–XIX веках, когда крестьянам массово давали фамилии по месту жительства.