Фамилия Милийана — редкий случай в русском ономастиконе. В ней нет привычного фамильного суффикса (-ов, -ин, -ский), что сразу выдает нерусское происхождение. Скорее всего, перед нами русифицированная форма грузинской, армянской или греческой фамилии. В грузинском языке, например, фамилии на -ани (-иани) широко распространены, и Милийана могла возникнуть из грузинского Милиани (от имени Милия или от топонима). Ударение в русском языке обычно падает на последний слог: Милийана́.

Основа фамилии восходит к личному имени Милий. Это имя имеет латинские корни: римское родовое имя Aemilius (Эмилий) означает «соперник» или «ревностный». В христианской традиции известен святой Милий, персидский воин, принявший мученическую смерть. Таким образом, Милийана — это «потомок Милия», но оформленная по южной, кавказской модели, а не по русской.

Географически фамилия тяготеет к югу России, Краснодарскому краю, Ставрополью, а также к Грузии и Армении. Встречается она крайне редко — носителей можно пересчитать буквально по семьям. Это фамилия, которая почти наверняка указывает на смешанные браки или миграцию: греческие и армянские переселенцы, оседая на Кубани и в Закавказье, адаптировали свои фамилии к местному произношению, но сохранили исконный суффикс.

С социальной точки зрения, предки носителей фамилии Милийана вряд ли принадлежали к дворянству — скорее, это были крестьяне, ремесленники или священнослужители. Имя Милий не было широко распространено в народе, поэтому фамилия могла возникнуть в среде духовенства, где часто давали имена по святым, или в среде греческих колонистов Причерноморья.

Если сравнивать с однокоренными русскими фамилиями, то ближайшая параллель — Милиев или Мильев, но Милийана стоит особняком: она сохранила окончание, которое в русском языке воспринимается как женское, хотя сама фамилия не склоняется по родам (и мужчина, и женщина — Милийана). Это еще раз подчеркивает её иноязычное происхождение и делает фамилию заметной даже в списке редких.