Фамилия Мильке образована от немецкого существительного Milch, которое переводится на русский язык как «молоко». Основатель рода, вероятно, был молочником. Согласно другой гипотезе, фамилия Мильке может быть образована от французского miel, то есть «мед». В этом случае, родоначальник мог заниматься изготовлением и продажей меда.