Фамилия Милькевич образована по модели, типичной для украинской и белорусской ономастики, с патронимическим суффиксом -вич. Этот суффикс указывает на происхождение по отцу: Милькевич — это «сын Милька». В основе лежит прозвище Милёк, которое, в свою очередь, восходит к украинскому слову «милий» — «милый, дорогой, любимый».

Скорее всего, такое прозвище давали либо ребенку, которого ласково называли в семье, либо обаятельному взрослому человеку с мягким, располагающим к себе характером. Аналогичные имена-прозвища от корня «мил-» встречаются и в других славянских традициях (например, Милай, Милко), но именно форма Милькевич закрепилась как фамилия в украинской среде.

Интересно, что написание фамилии с мягким знаком перед суффиксом — «Милькевич» — отражает смягчение согласного в произношении. В некоторых регионах встречается и вариант «Милкевич» без мягкого знака, что связано с особенностями местных говоров и правилами записи фамилий в документах. Обе формы имеют единое происхождение и не меняют смысл фамилии.

Со временем потомки человека с прозвищем Милёк, которые носили отчество Милькевич, передали его следующим поколениям уже как родовое имя. Так прозвище, данное за душевные качества, превратилось в наследственную фамилию, сохранившую память о предке, которого окружающие называли ласково и тепло.