Фамилия Мильковицкий — один из тех случаев, когда географическое происхождение просматривается почти наверняка, а вот с корнем слова возможны варианты. Сразу бросается в глаза суффикс -ицк-, характерный для польской и западнорусской ономастики. Фамилии на -ицкий (или -ицкий) обычно указывают на выходца из конкретного места — села, местечка или усадьбы, название которой оканчивалось на -ице (по-польски -ice). Носитель фамилии Мильковицкий, скорее всего, был человеком «с Мильковиц» — то есть из населённого пункта с похожим именем.

Где искать эти Мильковицы? На карте Польши, Беларуси и Украины встречается несколько топонимов с основой Мильк-: Мильковице (Milkowice) в Нижнесилезском воеводстве, Мильковичи (Milkovichi) в Брестской области. Однако корень может быть не топографическим, а личным. В основе фамилии лежит либо прозвище, либо имя Милько — уменьшительная форма от славянских имён Мил, Милан, Милован (от корня «мил» — дорогой, любимый). В этом случае Мильковицкий — это «сын Милько», то есть потомок человека по прозвищу Милько.

Суффикс -ский в этой модели (как и в фамилиях Ковальский, Соколовский) поначалу закреплял за человеком статус шляхтича или владельца земли. Но к XIX веку, особенно на территории бывшей Речи Посполитой, такие фамилии перестали быть дворянской привилегией. Крестьяне и мещане, переселяясь, нередко «присваивали» себе фамилию по названию родной деревни, даже если не владели ею. Так что предки Мильковицких могли быть и мелкими землевладельцами, и просто крестьянами из села Мильковичи.

Есть и менее вероятная, но любопытная версия: связь с немецким словом Milch (молоко). На территориях, где веками жили немецкие колонисты (например, в Галиции или на Волыни), прозвище «Мильк» могло получить молочник или торговец молоком. При переходе в польскую среду такое прозвище легко обрастало суффиксом -овицкий, превращаясь в Мильковицкого. Однако эта гипотеза слабее: в польской ономастике фамилии на -ицкий почти всегда привязаны к географическим названиям, а не к профессиям.

В написании фамилии встречается вариант «Мильковецкий» — это та же модель, но с другим суффиксом. Первоначальная форма могла звучать как «Милькович» (чисто патронимическая), а добавление -ский произошло уже в документах XIX века, когда чиновники унифицировали фамилии по польскому образцу. Таким образом, Мильковицкий — это фамилия-маркер: она указывает на корни в западнославянском регионе и на предка, которого звали Милько или который жил в Мильковицах.