Фамилия Мильянеко — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает все остальные версии. Основа фамилии — Мильян, испанская или итальянская форма имени Эмилиан (лат. Aemilianus, «соперник» или «ревностный»). Но ключевой элемент здесь — конечное -еко. В русском языке такой суффикс почти не встречается в исконных фамилиях, зато он характерен для украинских, белорусских и польских фамилий, особенно с запада Украины (например, Дяченко, Коваленко). Однако Мильянеко — не типичная славянская модель: ударение, скорее всего, падает на последний слог, что выдает влияние итальянского или испанского языка. Скорее всего, фамилия образована по модели, распространенной среди потомков греков, итальянцев или испанцев, осевших на юге Украины, в Крыму или в Одесской области в XVIII–XIX веках. Суффикс -еко мог быть адаптацией итальянского окончания -еко (как в фамилиях Бьянко, Риеко) или греческого -άκης (читается как «акис», но в русской записи могло превратиться в «еко»). Таким образом, Мильянеко — это, вероятно, «сын Мильяна» или «потомок Эмилиана», но в среде, где местное население переделало иностранную фамилию под привычную модель. Встретить её можно в южных областях России и Украины, а также у потомков переселенцев из Италии или Испании, но в массовом масштабе она не распространена. Есть версия, что фамилия могла возникнуть и на Кавказе, где суффикс -еко встречается в фамилиях армянского или грузинского происхождения, но для этого нет убедительных лингвистических подтверждений: имя Мильян там почти не фиксируется.