Фамилия Милюганов — наглядный пример того, как один суффикс может перевернуть всё привычное представление о происхождении. На слух она кажется типичной патронимической фамилией на -ов, то есть образованной от имени или прозвища предка. Но если приглядеться, основа здесь — не Милюган, а Милюга. Суффикс -ан в русских прозвищах часто выполнял роль усилителя: он придавал основе оттенок крупного размера, грубоватости или просто делал прозвище более «звучащим». Сравните: Губа — Губан, Нос — Носан, Рука — Рукан. Так и Милюга — скорее всего, производное от имени Милий (из латинского «миля» — воин) или от уменьшительного Миля, а уже от Милюги образовали Милюган — «большой Миля» или «тот, кто похож на Милюгу».

Впрочем, есть и более прозаичная версия. В южнорусских и украинских говорах слово «милюга» могло означать человека с мягким, «милым» характером, иногда даже с оттенком простоватости. Если так, то Милюганов — это потомок того, кого в округе звали Милюгой (ласково-ироничное прозвище). А суффикс -анов здесь вторичен: сначала было Милюга, потом — Милюганов, то есть «чей?» — Милюганов.

Географически фамилия редкая, но встречается в центральных областях России и на юге, особенно в бывших казачьих регионах. В дореволюционных метрических книгах Милюгановы записаны в основном как крестьяне и мещане, без явной привязки к дворянству. Это не удивительно: фамилия образована не от церковного календарного имени, а от прозвища, что типично для низших сословий.

Интересная деталь: в некоторых списках XIX века встречается вариант написания Милюганов с одной «н» — Милюганов. Это не ошибка, а следствие того, что суффикс -ан- в основе (Милюган) мог осознаваться как часть корня, и фамилию записывали по живому произношению. Но нормативным закрепился вариант с двумя «н», как в большинстве фамилий на -анов.

Таким образом, Милюгановы — это потомки либо человека по имени Милий (в его народной форме), либо обладателя прозвища Милюга, данного за характер. Точнее сказать сложно: письменных источников, которые бы подтвердили одну версию, нет. Но ясно одно: фамилия не искусственная, не книжная, а родилась в живой речи, в среде, где прозвища были точнее паспортов.