Фамилия Милюшкин образована по модели, которая широко встречается у восточных, западных и южных славян: от личного имени или прозвища с помощью уменьшительного суффикса и последующего притяжательного окончания. В основе лежит имя Милюшка — ласкательная форма от канонического Емилиан или же от славянского имени Мил, Милан, Милован. В первом случае корень восходит к греческому «льстивый, приятный в речах», во втором — к общеславянской основе «мил», то есть «милый, любезный». Обе версии правдоподобны, но вторая выглядит естественнее для народной речи: имя Мил и его производные были распространены задолго до христианства и не требовали книжного источника.

Суффикс -ушк- в имени Милюшка придавал оттенок нежности и принадлежности к семейному кругу. Так в быту звали ребёнка, младшего родственника или просто человека, к которому относились тепло. Фамилии на -ин, как Милюшкин, у славян традиционно означали «чей сын, чей человек»: Милюшкин — сын Милюшки. Подобные именования фиксировались в писцовых книгах и переписях с XVI–XVII веков, когда фамилия ещё не была наследственной, а указывала на отца. Позже она закрепилась за родом и передавалась уже как родовое прозвание.

Интересно, что однокоренные фамилии — Милютин, Миляев, Милушин — встречаются в разных регионах России независимо друг от друга. Это говорит не о едином центре распространения, а о том, что имя Мил и его формы были общенародными. Географически Милюшкины чаще встречаются в среднерусских и поволжских областях, но точной привязки к одному уезду нет — фамилия рассыпана по всей стране, что типично для прозвищных фамилий, возникших из домашнего имени.

Сословного барьера у фамилии не было: Милюшкиными могли записать и крестьянина, и посадского человека, и мелкого служилого. В документах XVIII–XIX веков носители фамилии встречаются среди государственных крестьян и мещан, но это скорее статистика, чем правило. Отдельных знаменитых носителей, которые бы прославили фамилию, в истории нет — она осталась фамилией обычных людей, что само по себе ценно для потомков: за ней стоит живая народная традиция именования, а не аристократическая генеалогия.

Если ваши предки носили фамилию Милюшкин, можно с высокой долей уверенности сказать: их родоначальника звали Милюшкой, и это имя ему дали за душевность или в детстве, как ласкательное. Фамилия не указывает на ремесло, место жительства или внешность — она говорит о тёплом отношении к человеку, что делает её редкой по смыслу среди множества «профессиональных» и «географических» фамилий.