Фамилия Миндигалимов — яркий пример тюркского наследия в русской ономастике. Её основа — сложное имя Миндигалим, которое состоит из двух частей. Первая часть, «мин», восходит к тюркскому слову «тысяча» или к имени племени (мин — одно из башкирских родовых подразделений). Вторая часть, «галим», — это арабское слово «алим», означающее «учёный», «знающий», «мудрец». Таким образом, имя Миндигалим можно перевести как «тысяча учёных» или «учёный из рода мин», что указывало на высокий статус или образованность предка.

Русский суффикс -ов превратил тюркское личное имя в фамилию, закрепившуюся в среде татар и башкир. По модели образования фамилия типична для Поволжья и Приуралья: к местному имени добавили русский патронимический суффикс, означающий «сын такого-то». Миндигалимовы — это буквально «потомки Миндигалима».

Географически фамилия плотнее всего встречается в Башкортостане и соседних регионах. Встречаются единичные варианты написания с одной «м» — Миндигалинов, но это скорее описка, чем устойчивая форма. Из-за арабского корня «галим» фамилия имеет смысловую параллель с более распространёнными Галимовыми, Миннегалимовыми и Абдулгалимовыми, где вторая часть та же, а первая варьируется (например, «минне» — «тысяча» в татарском произношении). Отличие Миндигалимова в том, что здесь «мин» не просто числительное, а, вероятно, указание на родовую принадлежность, что делает фамилию более конкретной исторически.

Социально предки Миндигалимовых могли быть муллами, учителями или уважаемыми старейшинами — людьми, чьё имя подчёркивало мудрость. Но не исключён и вариант, что имя дали в честь распространённого религиозного понятия, без прямой привязки к учёности носителя. Сословный состав — почти исключительно крестьянство и духовенство, дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.