Фамилия Минееы — редкий случай, когда орфография сразу бросается в глаза. Окончание «-еы» нехарактерно для русских фамилий: подавляющее большинство заканчивается на -ов, -ев, -ин, -ский, -их/-ых. Скорее всего, перед нами искажение или диалектное написание фамилии Минеев, где под влиянием местного произношения или ошибки писаря «ев» превратилось в «еы». В документах XVII–XIX веков, когда фамилии фиксировали на слух, такое встречалось: «е» и «ы» в безударной позиции могли путать, а твёрдый знак в конце слова нередко опускали.

Основа фамилии — имя Миней. Это краткая форма от канонического крестильного имени Миней (от греческого mēnē — «луна»), которое в святцах встречается редко. Но гораздо чаще Минеем называли человека в быту, сокращая имя Миней от полного Михаил или Дмитрий (по аналогии с Миня, Миша, Митя). Так что предок носителя фамилии Минееы, скорее всего, носил имя Миней — либо церковное, либо обиходное. Фамилия образована по стандартной модели «имя + суффикс -ев»: Миней → Минеев → (в искажённом виде) Минееы.

Географически фамилия Минееы почти не встречается в официальных переписях и справочниках. Если искать её в современных базах, то единичные случаи фиксируются на Русском Севере и в Поволжье — регионах, где в прошлом была высока доля неграмотного населения и писарские ошибки были обычным делом. В отличие от массовой фамилии Минеев (которая известна с XVI века и дала множество дворянских и купеческих родов), вариант Минееы — это локальный, «народный» след, сохранившийся вопреки унификации письменности.

Интересная деталь: если бы фамилия писалась как Минеев, её можно было бы спутать с однокоренной Минеев от слова «минея» (богослужебная книга). Но форма Минееы такой путаницы не допускает — она жёстко привязана к имени Миней. Так что, вопреки необычному виду, происхождение фамилии прозрачное: это отчество от личного имени, записанное с орфографическим сбоем.