Фамилия Мирзахнов — типичный пример фамилии, образованной от арабско-персидского составного имени. Её основа — «Мирзахан» или «Мирзахан», где первая часть «мирза» (от арабского «эмир-заде» — потомок эмира, княжич) указывала на знатное происхождение, а вторая — «хан» — тюркский титул правителя или военачальника. Таким образом, имя Мирзахан буквально означало «князь-хан» или «господин-правитель», подчеркивая высокий статус носителя. Русский суффикс -ов добавили при оформлении фамилии по стандартной модели: «чей?» — Мирзахнов, то есть сын или потомок Мирзахана.

Эта фамилия почти наверняка имеет татарское или башкирское происхождение. В среде татарской и башкирской знати (мурз, князей) имена с компонентом «мирза» были широко распространены. Фамилия Мирзахнов встречается в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской и Челябинской областях — регионах традиционного расселения татар и башкир. Интересно, что в дореволюционных документах можно встретить вариант написания «Мирзаханов» — с сохранением полной формы имени, но со временем в бытовой речи и при записи в метриках конечный -а мог отпадать, что и дало современное Мирзахнов.

Редкость фамилии в том, что она не просто фиксирует имя предка, а передаёт его социальный статус. В отличие от множества фамилий на -ов от простых имён (Иванов, Петров), Мирзахнов прямо указывает на то, что родоначальник принадлежал к служилому или даже княжескому сословию. В тюркской среде «мирза» — это не просто имя, а маркер происхождения от военной аристократии, так что предки современных Мирзахновых, скорее всего, были не крестьянами, а людьми «служилого чина» — мурзами или мелкими феодалами на окраинах Российского государства.

По фамилии можно судить и о времени её закрепления. Массовое присвоение фамилий татарам и башкирам происходило в конце XIX — начале XX века, но Мирзахновы, с их аристократической основой, могли получить фамилию раньше, ещё в XVIII столетии, когда представители знатных родов фиксировались в ревизских сказках и родословных книгах.