Фамилия Мисаил — редкий случай, когда фамилия полностью совпадает с каноническим мужским именем. В русской ономастике такие фамилии обычно относят к типу «неоформленных», то есть не получивших типичного фамильного суффикса (-ов, -ин, -ский). Они закрепились в виде чистой основы имени или прозвища и не склоняются как фамилии (хотя само имя Мисаил склоняемо).

Имя Мисаил — древнееврейского происхождения, означает «испрошенный у Бога» или «кто как Бог». В православной традиции это имя носил один из трёх отроков, не сгоревших в вавилонской печи (Анания, Азария, Мисаил). На Руси имя было монашеским, редким в миру. Поэтому фамилия Мисаил могла возникнуть двумя путями. Первый: её могли дать в семинарии или духовном училище — нередко будущим священникам меняли фамилию на церковное имя. Второй: фамилию мог получить внебрачный или подкинутый ребёнок, которого нарекли по святцам, и это имя стало родовым прозвищем без изменений.

Географически фамилия Мисаил встречается крайне редко, преимущественно в южнорусских и украинских областях, а также в среде старообрядцев, где были сильны архаичные формы именования. В переписных книгах XVII–XVIII веков можно найти единичные упоминания крестьян и казаков с таким именем, но как устоявшаяся фамилия она фиксируется поздно — в XIX веке.

Отсутствие суффикса говорит о том, что фамилия не прошла полную русификацию: в отличие от Мисаилов или Мисаильевых, носители фамилии Мисаил сохранили исходную форму. В быту такую фамилию могли путать с именем, что часто приводило к курьёзам в документах — например, в ревизских сказках могли записать «Мисаил» в графу «имя», а в графу «фамилия» ставить прочерк.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Мисаилов, Мисаильев) показывает, что форма без суффикса — самая древняя и редкая. Если ваша фамилия Мисаил, скорее всего, ваш предок был либо выходцем из духовного сословия, либо нёс это имя как прозвище, которое со временем стало наследственным.