Фамилия Мисарян — яркий пример армянской модели фамилии, указывающей на происхождение от конкретного предка. Она образована с помощью патронимического суффикса -ян, который в армянском языке означает «из рода» или «принадлежащий». В основе фамилии лежит личное имя или прозвище Мисар.

Само имя Мисар, скорее всего, является вариантом армянского имени Мисак, которое, в свою очередь, восходит к библейскому имени Мисаил. В Книге пророка Даниила Мисаил — один из трёх отроков, брошенных в огненную печь и чудесно спасённых. Имя это означает «кто как Бог?» (др.-евр. Ми-ка-Эль). В армянской среде библейские имена были широко распространены, и со временем форма Мисак могла трансформироваться в Мисар под влиянием местных диалектов или как ласкательный вариант.

Таким образом, фамилия Мисарян буквально означает «из рода Мисара» или «потомок Мисара». Предок, давший начало фамилии, мог быть человеком по имени Мисар, а его дети и внуки стали называться Мисарянами. В отличие от русских фамилий, которые часто закреплялись в определённом сословии (дворяне, крестьяне), армянские фамилии на -ян были всесословными и встречались и у священников, и у ремесленников, и у крестьян. Географически фамилия Мисарян наиболее характерна для исторических областей Западной Армении (ныне восток Турции), откуда многие носители впоследствии переселились в Россию, Армению и страны диаспоры.