Фамилия Мишенков входит в обширное и очень распространенное «гнездо» фамилий, образованных от имени Михаил. В переводе с древнееврейского это имя означает «богоравный», но в повседневной жизни полная форма почти не использовалась. Даже в XVIII веке Михаилом человека называли только в церкви или в торжественных документах, а в быту употребляли краткие и уменьшительные формы: Миша, Мишеня, Михайло, Мишук и другие.

Именно от одной из таких обиходных форм — Мишеня — и произошла фамилия Мишенков. Суффикс -енк- в данном случае указывает на отчество: Мишенков буквально означает «сын Мишени». Такая модель словообразования была особенно характерна для южнорусских и украинских земель, где фамилии с суффиксом -енко/-енков встречались повсеместно. В северных и центральных регионах России чаще использовали суффиксы -ов/-ев, поэтому форма Мишенков несет в себе отчетливый географический отпечаток.

Интересно, что уменьшительные формы имени Михаил в XVII–XIX веках были одними из самых частых в обиходе. От них за столетия образовалось целое «гнездо» родственных фамилий: Мишин, Мишагин, Мишуков, Михайлов, Мишнев и многие другие. По подсчетам лингвиста Б. Унбегауна, в Петербурге в 1910 году фамилии этого «гнезда» занимали пятое место по употребительности, уступая только Ивановым, Васильевым, Петровым и Смирновым. Так что Мишенковы — часть огромной семьи, корни которой уходят в одно из самых любимых на Руси имен.

Сам корень «миш-» восходит к древнееврейскому имени, но через многовековое употребление в русской среде он полностью утратил связь с исходным значением «богоравный». Для предков носителей фамилии имя было просто привычным домашним именованием, а фамилия закрепляла принадлежность к роду конкретного человека по имени Мишеня. Сегодня фамилия Мишенков встречается в разных регионах, но чаще всего — на юге России и в областях, исторически связанных с украинским влиянием.