Фамилия Мишутушкина — женская форма от Мишутушкин, а та, в свою очередь, образована от прозвища или имени Мишутушка. Это ласкательный вариант имени Михаил, где основа «Миш» (от «Миша») наращивается суффиксом -ут- и уменьшительным -ушк-. Модель знакомая: Мишута → Мишутка → Мишутушка. Такая цепочка — не редкость в русской ономастике, хотя финальный вариант с двойным уменьшительным суффиксом встречается реже, чем простые Мишин или Мишутин.

Корень, вопреки возможной догадке, не связан с глаголом «мишутить» или чем-то шутливым. В говорах «мишута» — именно ласковое обращение к Михаилу, без добавочных значений. Фамилии на -ушкин обычно принадлежали крестьянской или мещанской среде: их давали по домашнему, внутрисемейному прозвищу. То есть предок носительницы фамилии был, скорее всего, Михаилом, которого в быту звали Мишутушкой — и это прозвище закрепилось за его детьми.

Географически фамилия тяготеет к северо-западным и центральным регионам России. В переписных книгах XVII века подобные формы (Мишута, Мишутка) фиксируются в Новгородской и Псковской землях. Позже, с отменой крепостного права, носители могли расселиться шире, но плотность остаётся невысокой: Мишутушкины — редкая фамилия, не входящая даже в сотни самых частотных русских фамилий.

С точки зрения словообразования интересен суффикс -ушк-: он не просто уменьшительный, а указывает на особую нежность или возраст (ребёнок, младший член семьи). В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые часто означали «сын такого-то», суффикс -ин в Мишутушкин показывает прямую принадлежность: «чей?» — «Мишутушкин». То есть буквально: «маленький Мишута, сын Мишуты». Двойное уменьшение (Миш-ут-ушк-) подчёркивает, что прозвище дали не взрослому мужчине, а скорее мальчику или очень любимому человеку.

В написании возможна вариативность: в старых документах фамилию могли записать через «о» (Мишутошкин) или с одним «ш» (Мишутукин), но современная орфография закрепила форму с -ушк-. Женское окончание -а не меняет корня и не добавляет нового смысла: это стандартное склонение по падежам, типичное для русских фамилий.