Фамилия Мишутин отвечает на вопрос «чей ты будешь?» и образована от личного имени Мишута — так в старину ласково или попросту, по-домашнему, звали Михаила. Имя Михаил пришло на Русь вместе с крещением и в переводе с древнееврейского означает «благонравный» или, в более широком смысле, «тот, кто подобен Богу». Суффикс -ин в фамилии — один из древнейших в русской ономастике: он указывал на принадлежность конкретному человеку, то есть Мишутин — это буквально «сын Мишуты», потомок человека с таким именем.

Формы вроде Мишута, Михута, Мишата, Михей встречались повсеместно, но именно Мишута дала начало целому ряду фамилий: Мишутин, Мишуткин, Мишутов. Любопытно, что имя Мишута не было исключительно крестьянским — в документах XV–XVII веков встречаются и посадские люди, и служилые с таким прозванием. Фамилия закрепилась в центральных русских областях, а позже распространилась на север и в Поволжье, что отражает обычные пути миграции русского населения.

В отличие от фамилий на -ов, которые чаще образовывались от полных или церковных форм имени, Мишутин сохранил народное, разговорное звучание. Это говорит о том, что предок носителя фамилии в быту звался именно Мишутой, и такое обращение закрепилось в официальных документах. Кстати, в некоторых говорах Мишутой могли называть не только человека, но и медвежонка — в сказках и быличках это имя нередко давали лесному зверю, однако для фамилии основным остается антропонимическое значение.

Если говорить о социальном срезе, то фамилия не указывает на дворянское или, напротив, податное происхождение: Мишутины встречались среди крестьян, мещан, купцов. В переписных книгах XVII века упоминаются крестьяне Мишутины в вотчинах под Суздалем и Муромом, а в более поздних метрических книгах — уже в Сибири, куда фамилию принесли переселенцы. Таким образом, фамилия — типичный образец русской отчества-патронимической модели, и ее носитель может быть уверен: его родословная восходит к человеку по имени Мишута, а значит — к Михаилу.