Фамилия Мишутина образована от имени Мишута, народной формы крестильного мужского имени Михаил, которое в переводе с древнееврейского языка означает «благонравный». Скорее всего, основатель рода Мишутиных был выходцем из простого сословия. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Мишута, со временем получил фамилию Мишутина.