Фамилия Мисников образована от прозвища Мисник, которое, вероятно, восходит к украинскому нарицательному «мисник», что в переводе на русский язык означает «полка, шкаф для посуды, иногда для продуктов в сельском доме». Можно предположить, что прозвище Мисник получил человек, занимающийся изготовлением домашней мебели. Кроме того, так могли прозвать состоятельного человека, у которого всегда было вдоволь продуктов. Согласно другой версии, прозвище Мисник восходит к нарицательному «мясник». Чередование гласных я/и стало результатом исторических процессов, происходивших в ходе развития языка. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Мисник, со временем получил фамилию Мисников.