Фамилия Миснянкин — редкий пример, где суффикс -ин указывает не на отчество от крестильного имени, а на прозвище, связанное с местностью. Чтобы понять её корень, нужно смотреть не в сторону «миссии» или «минуса», а на южнорусские говоры.

Основа фамилии — «Миснянка». Это название жительницы определённой местности, деревни или хутора. Суффикс -янк- (как в «полтавка», «черкешенка») образует этнохороним — слово, обозначающее уроженку какого-то места. Мужчина из того же села назывался бы «Мисняк» или «Миснянец». Соответственно, Миснянкин — «чей?» — сын Миснянки, то есть человек, чья мать или жена происходила из поселения с корнем «Мисн-».

Где искать это село? В ономастике известна фамилия Мисник (и её варианты Мисников, Мисниченко), которую выводят от названия реки Миссисипи — но это шуточная версия для украинских переселенцев, не имеющая отношения к реальной этимологии. Серьёзные топонимы с корнем «Мисн-» встречаются в бассейне Дона и в бывшей Слобожанщине: например, урочище Миснянка или балка Миснякова. Там в XVI–XVII веках селились служилые люди и «черкасы» (переселенцы с Украины).

Интересно, что фамилия Миснянкин почти не встречается за пределами Курской, Белгородской и Воронежской областей. Это верный признак локального прозвища, которое закрепилось как фамилия в одном или нескольких соседних сёлах. В переписных книгах XVII века такой фамилии нет — она оформилась поздно, в XVIII–XIX веках, когда крестьянам массово давали фамилии по месту выхода.

Таким образом, предок носителя фамилии Миснянкин был, скорее всего, выходцем из маленького поселения, которое называлось Миснянка или Мисняки. Его самого в документах могли записать как «Миснянкин сын» — буквально «сын женщины из Миснянки». В этой фамилии нет ни дворянской родословной, ни громких исторических лиц, но есть точная географическая привязка к чернозёмной полосе России, где до сих пор живут её носители.