Фамилия Мисюрко — один из тех случаев, где корень говорит больше, чем суффикс. Основа здесь — «мисюр» (или «мисюрь»), а окончание «-ко» указывает на украинское или белорусское происхождение. В этих языках суффикс «-ко» — типичный патронимический или уменьшительный, он превращает прозвище или имя в фамилию: Мисюрко буквально значит «маленький Мисюр» или «потомок Мисюра».

Само слово «мисюр» в старину имело конкретное значение. Мисюркой называли разновидность шлема — невысокую шапку с металлической тульей и кольчужной сеткой для защиты шеи и лица. Такой шлем был распространён в русском и польском войске XVI–XVII веков. Прозвище Мисюр могли дать воину, который носил такой шлем, или мастеру, который их ковал. Но есть и вторая версия: в южных говорах «мисюр» иногда означало «египтянин» (от искажённого «мисри» — арабское название Египта), и прозвище могло достаться человеку смуглому или приезжему с юга. Правдоподобнее, однако, связь с военным снаряжением — она конкретнее и подтверждается другими фамилиями того же ряда: Мисюрев, Мисюрин.

Географически фамилия Мисюрко тяготеет к западу и югу России: чаще всего она встречается в Смоленской, Брянской областях, а также в Беларуси и на Украине. Это не случайно — именно в этих землях польско-литовское влияние смешивалось с русским, а суффикс «-ко» был нормой для фамилий простых людей. В отличие от великорусских фамилий на «-ов», Мисюрко не указывает на владельческий статус или вотчину, а прямо называет человека по его прозвищу.

Словообразовательная модель проста: прозвище Мисюр (или Мисюра) + уменьшительно-притяжательный суффикс «-ко». Аналогов много: Ковалько, Грицько, Харько. Никакой дворянской этимологии здесь нет — это фамилия ремесленника, воина или крестьянина, которую записали по отцу или по характерной черте.