Фамилия Мисюрина образована от прозвища Мисюра, и корень у неё — военный. Основная версия связывает прозвище с нарицательным «мисюрка»: так называли воинскую шапку с железной маковкой или теменем и кольчужной сеткой, защищавшей шею и плечи. Такой головной убор носили в XVI–XVII веках, и прозвище Мисюра мог получить либо тот, кто служил в войске и носил мисюрку, либо, что не менее вероятно, мастер, который эти шапки ковал или чинил. В любом случае, прозвище указывало на род занятий, а не на внешность.

Есть и вторая, менее правдоподобная версия: от глагола «мичуриться» — «хмуриться, морщиться, глядеть исподлобья, сердито». Тогда Мисюрой называли угрюмого, нелюдимого человека. Но эта гипотеза слабее: глагол редкий, локальный, и связь его с прозвищем выглядит натянутой. Скорее всего, перед нами именно «военная» фамилия.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Мисюрина — «дочь или жена Мисюры», а в более раннем значении — «человек из рода Мисюры». Такая модель типична для северных и центральных русских говоров, где притяжательные фамилии на -ин образовывались от слов мужского рода на -а. В южных регионах чаще использовали бы форму Мисюренко или Мисюров.

Интересно, что фамилия сохранила ударение на втором слоге — Мисю́рина, что тоже говорит в пользу «военной» версии: ударение в прозвище падало на корень, как и в слове «мисю́рка». Если бы основой был глагол «мичуриться», форма скорее звучала бы как Мичурин — и такая фамилия действительно существует, но это отдельная линия, не связанная с Мисюриной.

Прозвище Мисюра не было редкостью в писцовых книгах XVI–XVII веков, особенно в районах, где стояли гарнизоны и проходили торговые пути. Потомки таких людей, осев на землю, постепенно теряли связь с военным делом, но фамилия закрепила память о предке-ратнике. Сегодня фамилия Мисюрина встречается в основном в Центральной России и Поволжье, что согласуется с историей расселения служилых людей.