Фамилия Митроченков — один из вариантов русского отчества, которое образовали от имени Митроха. В основе лежит каноническое имя Митрофан (греч. «явленный матерью»), но в народной речи оно дало целый ряд производных: Митроха, Митроша, Митроня. Суффикс -енков указывает на восточнославянскую модель: «чей?» — Митроченков, то есть «сын Митроченка», а Митроченок — в свою очередь, «сын Митрохи». Такая цепочка типична для фамилий, которые закрепились в XVI–XVII веках, когда отчества на -енко (украинское влияние) и -енков (русская адаптация) активно вытесняли прямые патронимы на -ов.

Особенность фамилии — её редкий суффиксальный вариант. Если Митрофановых и Митрохиных по России много, то Митроченковы встречаются значительно реже. По данным современных справочников, основное гнездо фамилии — южные области России: Курская, Белгородская, Воронежская. Это не случайно: форма на -енков характерна для территорий, где смешивались великорусские и малороссийские говоры. Предки носителя фамилии, скорее всего, были крестьянами или однодворцами — сословием, которое формировалось на южных рубежах государства.

Сам прозвищный корень Митроха — не просто сокращение. В диалектах слово «митроха» могло означать «простак» или «увалень», но вряд ли это значение напрямую перешло в фамилию: отчества от крестильных имён редко несли негативный оттенок. Гораздо вероятнее, что Митроченков — нейтральный патроним, который просто фиксирует имя отца или деда.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, Митроченков стоит в одном ряду с Митрошенковым, Митрофановым, Митрохиным, но отличается именно суффиксом -енков, который в русской ономастике считается «младшим» — он появляется позже классических -ов/-ев. Это не делает фамилию менее древней, но говорит о том, что она оформилась в среде, где ещё в XVII–XVIII веках сохранялась традиция называть сына по уменьшительной форме отца.