Фамилия Мизавцева — редкая, и её происхождение неочевидно. Наиболее вероятная версия связывает её с диалектным словом «мизавец» — так в некоторых говорах называли неопрятного, неряшливого человека. В словаре В. И. Даля встречается глагол «мизать» в значении «мазать, пачкать», а также «мизуля» — грязнуля. Прозвище Мизавец мог получить неаккуратный или небрежный в работе человек. От него и пошла фамилия: Мизавец → Мизавцев, а женская форма — Мизавцева.

Суффикс -ев указывает на принадлежность: Мизавцева буквально означает «жена или дочь Мизавцева», то есть человека из рода Мизавцевых. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ на -ец с последующим притяжательным суффиксом. Фамилия явно недворянская и не искусственная (вроде семинарских); скорее всего, она возникла в крестьянской или мещанской среде.

Менее вероятна, но не исключена версия от тюркского корня «миза» — «узор, орнамент». В таком случае прозвище Мизавец мог получить мастер-вышивальщик или резчик по дереву. Однако эта гипотеза слабее, потому что суффикс -ец в русских фамилиях редко присоединяется к заимствованным основам без промежуточного адаптирующего слова.

Географически фамилия привязана к центральным и южным областям России. В дореволюционных метрических книгах Мизавцевы фиксировались в Тамбовской, Воронежской и Рязанской губерниях — регионах, где диалектное слово «мизать» было в ходу. Встречаются варианты написания через «ы» — Мызавцев, что тоже говорит о народном произношении. Поскольку фамилия редкая, её носители, скорее всего, потомки одного рода, разошедшегося по разным уездам.