Фамилия Мизернова образована от прозвища Мизерный. В русских говорах слово «мизерный» означало «маленький, худой, тщедушный», а также «бедный, скудный, ничтожный». Прозвище могли дать невысокому или слабосильному человеку, либо тому, кто жил бедно и неприметно. В отличие от многих «характерологических» фамилий, здесь нет суффикса принадлежности (вроде -ов или -ин) — основа напрямую стала фамилией через форму родительного падежа: Мизернов — «чей?» — «сын Мизерного». Женская форма Мизернова — это просто вариант, который исторически закрепился за женщинами в роду.

Интересно, что прилагательное «мизерный» — книжного происхождения, из латинского miser («жалкий, несчастный»), и в народную речь попало через семинарскую среду или канцелярский язык. Поэтому фамилия могла возникнуть не в крестьянской среде, а среди духовенства или мелких чиновников, где прозвища давали по внешности или положению. Встречается она преимущественно в центральных и южных регионах России — в документах XVIII–XIX веков Мизерновы фиксируются в Тамбовской, Рязанской и Воронежской губерниях.

Редкость фамилии объясняется не только негативным оттенком основы, но и тем, что в крестьянской среде чаще использовали более конкретные прозвища. Мизерный — скорее оценка, чем описание занятия, поэтому носителей было немного. В современных справочниках фамилия Мизернова встречается единично, что делает её ценной для генеалогического поиска: чем реже фамилия, тем точнее можно восстановить родственные связи по архивным записям.