Фамилия Мизернюк образовалась от прозвища Мизерный, которое в старину давали человеку за внешность или положение. Основа здесь — слово «мизер», пришедшее в русский язык из французского (misère — «бедность, нужда»). Прилагательное «мизерный» в России означало не только «бедный» или «жалкий», но и «слабый, хилый», а также «маленький». Поэтому прозвище могли закрепить за человеком невысокого роста и хрупкого телосложения, а не только за тем, кто бедствовал.

Сама фамилия построена по украинской модели с суффиксом -юк, который указывает на принадлежность: Мизернюк — это «сын Мизерного» или «человек из рода Мизерных». Такая форма типична для западных регионов Украины и Беларуси, где фамилии с этим суффиксом встречаются особенно часто. Со временем прозвище Мизерный, которое изначально сопутствовало наследственному имени, полностью вытеснило его и в быту, и в официальных бумагах, закрепившись как фамилия.

Интересно, что в русском языке слово «мизерный» имело и оттенок «скудный, ничтожный», поэтому в некоторых говорах прозвище могло нести ироничный смысл — так могли назвать человека, который прибеднялся или жаловался на жизнь. Однако в основе фамилии чаще видится именно внешняя характеристика, а не моральная оценка.