Фамилия Мизерная — редкий случай, когда прилагательное в женском роде стало фамилией, не перейдя в стандартную форму на -ов или -ин. Это так называемая «окаменевшая» форма, характерная в основном для украинской, белорусской и южнорусской традиции, где фамилии могли закрепляться в виде полного прилагательного: Мизерная, Дегтярная, Толстая. В русском же языке такие фамилии обычно мужского рода — Мизерный, — но женская форма могла закрепиться за носительницей без изменений, если она была главой семьи или вдовой, или же если фамилию записали в документах по материнской линии.

Основа фамилии — прилагательное «мизерный», то есть «ничтожный, скудный, бедный, маленький». В словаре Владимира Даля «мизера» означает «бедность, нищета», а «мизерный» — «убогий, жалкий, скудный». Прозвище Мизерный могли дать человеку невысокого роста, худощавого телосложения или тому, кто жил в крайней бедности. В отличие от многих «экономических» прозвищ, это не обязательно было оскорблением — часто такие имена давали по внешнему признаку или как оберег, чтобы отвести настоящую нужду.

Встречается фамилия и в польском контексте, где «mizerny» означает то же самое — «бледный, хилый, слабый». На территории бывшей Речи Посполитой фамилии с таким корнем могли получить польские или белорусские крестьяне, а затем, после разделов, перейти в русскую документацию. Интересно, что в некоторых говорах «мизера» означала не только бедность, но и «мелочь, пустяк», что указывает на возможное прозвище для человека, занимающегося мелочной торговлей или скрупулёзного в делах.

Географически фамилия Мизерная встречается в основном на юге России, в Ростовской области, Краснодарском крае, а также в Беларуси и на востоке Украины. Это не массовая фамилия, и её носители, скорее всего, происходят из крестьянской или мещанской среды, где прозвища давали по внешности или имущественному положению. В дворянских родословных она не зафиксирована — слишком «неблагозвучная» основа для аристократии.

С точки зрения словообразования, фамилия не содержит суффиксов принадлежности (-ов, -ин), что делает её архаичной. Если бы она оформлялась по стандартной русской модели, мы бы имели Мизернов или Мизерин, но форма Мизерная сохранила исходное прилагательное, что типично для южных и западных регионов. Встречается также вариант Мизерный — его носители, вероятно, происходят из тех же мест, но фамилия была записана в мужском роде.