Фамилия Мизий — редкий случай, когда географическое название стало личным прозвищем, а затем закрепилось в роду. В её основе лежит слово «мизиец» — житель древней области Мизия на Балканах (территория современных Болгарии, Сербии, Румынии). В русских говорах так могли называть выходца с Балкан, болгарина или серба, либо человека, торговавшего с южными землями. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые образуются от имён и прозвищ с помощью притяжательного суффикса, Мизий сохранил исходную форму этнонима без дополнительных наращений — это указывает на то, что прозвище было дано взрослому человеку и не перешло к детям через патронимический суффикс. Такая модель встречается у фамилий, которые не успели «обрусе́ть» до окончания -ов: они застыли в виде чистого названия народа или места.

Вторая, менее вероятная версия связывает фамилию с греческим именем Мизий (Μύσιος) — так звали одного из персонажей античной мифологии, а в христианской традиции — святого Мизия, почитаемого в Византии. Но если бы фамилия пошла от крестильного имени, мы бы ожидали форму Мизиев или Мизин — с типичным русским суффиксом. Поэтому версия с этнонимом правдоподобнее.

Фамилия встречается в основном в двух регионах: на юге России (Краснодарский край, Ростовская область) и в украинском Причерноморье — там, где исторически селились выходцы с Балкан в XVIII–XIX веках. Встречается она и у потомков запорожских казаков, среди которых были люди, ходившие в походы на Балканы и привозившие оттуда не только трофеи, но и прозвища. Сословная принадлежность носителей — чаще крестьяне или мещане, но документальных подтверждений дворянского происхождения нет, что тоже косвенно говорит в пользу «народного» корня.

Интересно, что фамилия Мизий почти не имеет однокоренных «родственников» в русском ономастиконе — нет ни Мизиевых, ни Мизиных в массовом количестве. Это делает её своеобразным маркером: если вы встретили Мизия, скорее всего, его предки действительно были связаны с южными славянами или имели прозвище, указывавшее на балканское происхождение.