Фамилия Могилилин — одна из тех, что с первого взгляда кажется понятной, но при ближайшем рассмотрении ставит вопросы. Корень здесь прозрачен: «могил-», от слова «могила». Но как именно он превратился в фамилию — не так очевидно.

Словообразовательная модель редкая. Суффикс «-илин» встречается в русских фамилиях нечасто. Чаще мы видим «-ин» (Могилин) или «-ов» (Могилёв). Удвоенный суффикс «-илин» указывает на то, что основой послужило не существительное «могила», а скорее прилагательное или прозвище — например, «Могилила». Такие формы в старину давали человеку с трудным, мрачным нравом или тому, кто жил у кладбища. В говорах «могилила» могло означать и угрюмого, замкнутого человека.

Вторая версия — топонимическая. Фамилия могла возникнуть от названия населённого пункта вроде Могилино или Могилицы. Такие деревни встречаются в центральной России, особенно в бывших Рязанской, Тамбовской и Владимирской губерниях. Житель такой деревни получал прозвище «Могилила», а его потомки — фамилию с суффиксом принадлежности.

Версия о происхождении от церковного имени маловероятна: прямых аналогов в святцах нет. Но можно предположить, что в основе лежало прозвище, данное за профессию — например, могильщику. В документах XVII–XVIII веков встречаются фамилии Могилев, Могильников, а Могилилин — более редкий вариант, сохранившийся, вероятно, в узком региональном ареале.

Социальный состав носителей, скорее всего, был крестьянским или посадским. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. В современных справочниках фамилия встречается единично, в основном в Центральной России и Поволжье.