Фамилия Мокляк образована от прозвища, которое в старину звучало как «моклок». Так называли мосол, бедренную кость, поэтому прозвище могли дать либо крупнокостному, либо, наоборот, худощавому человеку — тому, у кого кости выступали заметно. Впрочем, есть и вторая версия: слово «моклак» в некоторых говорах означало «торгаш, барышник», и тогда прозвище указывало на род занятий предка.

В старинных документах встречаются родственные именования. У С. Б. Веселовского упоминаются Моклок Тарбеев, землевладелец первой половины XVI века из Переяславля, и Тимофей Семенович Моклоков, ямской дьяк 1492 года. Эти записи показывают, что основа «моклок» бытовала в разных слоях общества — от дьяков до землевладельцев.

Сама фамилия Мокляк выглядит как краткая форма от той же основы: суффикс -як в русских фамилиях и прозвищах часто указывал на человека по характерному признаку или поведению (сравните с фамилиями типа Бодряк, Добряк). В украинской и белорусской традиции такой суффикс тоже был распространён, поэтому фамилия Мокляк могла закрепиться и на западнорусских землях, где прозвищные фамилии часто сохранялись без дополнительных патронимических суффиксов.

Если исходить из первой версии, предок носителя фамилии выделялся телосложением — возможно, был высоким и ширококостным, и окружающие окликали его по заметной кости. Если верна вторая — он промышлял торговлей, перепродажей, и прозвище отражало его занятие. Обе гипотезы имеют право на существование, но первая, от «моклока» как части тела, выглядит более естественной: такие прозвища по внешности давали чаще, чем по роду занятий, и они легче закреплялись за человеком.

Встречается и вариант написания Мокляк с ударением на последний слог, что типично для украинских и южнорусских фамилий. В документах XIX века фамилия фиксируется в основном в Полтавской, Черниговской и Харьковской губерниях, что подтверждает её связь с украинской прозвищной традицией.