Фамилия Мокушин образована от имени или прозвища Мокуша — так в старину могли звать человека, носившего имя Мокий. Само имя пришло из греческого языка и переводится как «насмешник». Покровителями этого имени считаются несколько святых: мученик Мокий Чтец, чья память отмечается 11 февраля, священномученик Мокий и праведник Мокий, которых поминают 24 мая и 31 декабря, а также мученик Мокий, дни памяти которого приходятся на 16 июля и 20 августа.

Словообразовательная модель здесь простая и типичная для русских фамилий: к основе Мокуш- добавили суффикс -ин, который указывает на принадлежность. То есть Мокушин буквально означает «сын Мокуши», «тот, кто из рода Мокуши». Форма Мокуша — это уменьшительно-ласкательный или обиходный вариант имени Мокий, подобно тому как от Ивана получается Иваша, а от Григория — Гриша.

Интересно, что в народной среде имя Мокий часто переосмысляли. Из-за созвучия с глаголом «мокнуть» и словом «мокрый» его связывали с сырой, дождливой погодой. Отсюда в некоторых говорах появились поговорки, а сам Мокуша мог стать прозвищем человека, который часто промокал под дождём или работал у воды. Впрочем, эта версия вторична: основой фамилии всё же послужило каноническое имя, а не бытовое прозвище.

Фамилия Мокушин встречается в центральной России и в Поволжье. Встречаются и родственные фамилии, образованные от тех же корней: Мокеев, Мокин, Мокшин. Если ваши предки носили фамилию Мокушин, с большой долей вероятности среди них был человек по имени Мокуша — так домашние и соседи звали Мокия. Потомки этого человека со временем закрепили за собой фамилию по имени родоначальника, и она передавалась из поколения в поколение.