Фамилия Молачков — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Чтобы понять её корень, нужно отбросить суффикс -ов, типичный для русских фамилий, и присмотреться к основе «Молачк-». Здесь сразу бросается в глаза характерный южнославянский или западнорусский оттенок: слово «молачк» или «молачка» могло быть прозвищем, образованным от глагола «молотить». В диалектах белорусского и украинского языков «молач» — это молотильщик, работник на току. Суффикс -к- в таком случае придаёт прозвищу уменьшительно-бытовой оттенок: Молачок — это «маленький молотильщик» или сын молотильщика. Соответственно, Молачков — «сын Молачка», то есть потомок человека, занятого обмолотом зерна.

Версия с молотьбой — самая прямая и правдоподобная, но есть и другой поворот. В некоторых говорах «молач» могло означать не молотильщика, а «молодца» или «бойкого парня» — от общеславянского «молод» с переходом «д» в «ч» на местном диалектном уровне. Такое фонетическое изменение (молод → молач) встречается в псковских и тверских говорах. Если это так, то прозвище Молачок давали не по ремеслу, а по характеру: вертлявый, удалой, «молодчик». Обе версии сходятся в том, что фамилия крестьянская, недворянская, и её носители, скорее всего, были земледельцами или ремесленниками в центральной или западной части России.

Географически фамилия Молачков тяготеет к Смоленщине, Брянщине и границе с Беларусью. В дореволюционных переписях она встречается единично, чаще в форме «Молачков» или «Молачко» (без суффикса). Важно не путать её с более известной фамилией Молочков — та образована от слова «молоко» и связана с торговлей молоком, а не с молотьбой. В фамилии Молачков корень именно с «а» и с «ч», что уводит нас в сторону процесса молотьбы, а не продукта. Так что предки современного носителя фамилии, скорее всего, работали на току, в поле, а не на рынке.