Фамилия Молодченкова — женская форма фамилии Молодченков, и в её основе лежит прозвище или мирское имя, связанное с молодостью. Разбираем словообразовательную модель: корень «молод-», суффикс «-ченков» (вариант патронимического суффикса «-енков» с чередованием к/ч) и окончание «-а» для женского рода. Суффикс «-енков» (в диалектах — «-онков») характерен для южнорусских и украинских фамилий, особенно для регионов, где была распространена «окающая» или «якающая» речь. Это сразу указывает на географию: предки Молодченковых, скорее всего, жили на территории современных Курской, Белгородской, Воронежской областей или в Слобожанщине. В отличие от более частотной модели «-ов» (Молодцов), суффикс «-енков» встречается реже и говорит о более позднем закреплении фамилии (XVII–XVIII века), когда патронимы на «-енко» начали русифицироваться добавлением «-в».

Основа «Молодченко» (или «Молодча» в краткой форме) — это прозвище. Самое прямое объяснение: так могли назвать младшего сына, юношу, или человека, который выглядел моложе своих лет. В старину прозвища «Молодец», «Молодой» давали не столько по возрасту, сколько по статусу — например, холостому парню или подручному в ремесле. В словаре русских фамилий Б. Унбегауна указывается, что фамилии на «-ченко» часто образовывались от имён и прозвищ с уменьшительными суффиксами: «Молодченко» — это «маленький молодой» или «сын Молодца». Есть и менее очевидная версия: в некоторых говорах «молодчик» означало не только юношу, но и бойкого, ловкого человека, иногда с оттенком «пройдоха». Если предок носил такое прозвище, фамилия могла отражать его характер, а не возраст.

Сравните с однокоренными фамилиями: Молодцов (от «молодец» — более книжное и распространённое), Молодых (северная модель, указывающая на целый род), Молодкин (от уменьшительного «Молодка»). Молодченкова стоит в этом ряду как «сыновья» фамилия с южным колоритом. В дореволюционных переписях и метрических книгах такая фамилия почти не встречалась среди дворянства — это крестьянская или мещанская среда, где прозвище передавалось по наследству без сословных претензий. Споров о происхождении корня нет: «молод-» — общеславянская основа, и все версии укладываются в два-три бытовых сценария. Единственная деталь, которую стоит отметить: в написании иногда путают «Молодченкова» и «Молодчинкова» (через «и»), но второй вариант — ошибка, так как суффикс «-инков» встречается в фамилиях от женских имён (Марьинков), а здесь основа мужская.